Protein–RNA interactions for Protein: P09056

Lif, Leukemia inhibitory factor, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifP09056 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifP09056 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifP09056 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifP09056 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifP09056 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LifP09056 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LifP09056 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifP09056 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifP09056 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LifP09056 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LifP09056 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LifP09056 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifP09056 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifP09056 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LifP09056 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LifP09056 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifP09056 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LifP09056 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LifP09056 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifP09056 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LifP09056 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifP09056 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LifP09056 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LifP09056 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LifP09056 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LifP09056 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LifP09056 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LifP09056 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LifP09056 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LifP09056 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LifP09056 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LifP09056 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LifP09056 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LifP09056 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LifP09056 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms