Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxd3P09027 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxd3P09027 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms