Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt13P08730 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt13P08730 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt13P08730 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt13P08730 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt13P08730 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt13P08730 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt13P08730 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt13P08730 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt13P08730 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms