Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Me1P06801 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Me1P06801 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Me1P06801 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Me1P06801 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Me1P06801 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Me1P06801 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Me1P06801 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Me1P06801 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Me1P06801 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Me1P06801 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Me1P06801 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Me1P06801 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Me1P06801 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Me1P06801 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Me1P06801 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Me1P06801 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Me1P06801 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Me1P06801 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Me1P06801 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Me1P06801 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Me1P06801 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Me1P06801 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Me1P06801 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Me1P06801 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Me1P06801 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Me1P06801 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Me1P06801 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Me1P06801 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Me1P06801 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Me1P06801 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Me1P06801 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Me1P06801 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Me1P06801 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Me1P06801 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Me1P06801 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Me1P06801 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Me1P06801 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Me1P06801 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Me1P06801 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Me1P06801 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Me1P06801 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Me1P06801 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Me1P06801 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Me1P06801 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Me1P06801 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Me1P06801 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Me1P06801 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Me1P06801 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Me1P06801 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Me1P06801 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Me1P06801 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Me1P06801 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Me1P06801 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Me1P06801 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Me1P06801 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Me1P06801 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Me1P06801 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Me1P06801 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Me1P06801 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Me1P06801 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Me1P06801 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms