Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01794 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01794 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01794 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01794 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01794 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01794 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01794 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01794 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01794 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01794 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01794 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01794 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01794 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01794 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01794 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01794 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01794 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01794 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01794 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01794 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01794 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms