Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01793 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01793 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01793 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01793 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01793 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01793 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01793 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01793 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01793 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01793 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01793 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P01793 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01793 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01793 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01793 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01793 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01793 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01793 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01793 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01793 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01793 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01793 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01793 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01793 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01793 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms