Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Actn3O88990 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn3O88990 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn3O88990 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Actn3O88990 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Actn3O88990 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Actn3O88990 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Actn3O88990 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn3O88990 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Actn3O88990 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn3O88990 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Actn3O88990 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms