Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp2O88623 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp2O88623 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp2O88623 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp2O88623 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp2O88623 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp2O88623 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms