Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Aff1O88573 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aff1O88573 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Aff1O88573 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff1O88573 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Aff1O88573 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Aff1O88573 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff1O88573 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aff1O88573 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms