Protein–RNA interactions for Protein: O88531

Ppt1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt1O88531 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ppt1O88531 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt1O88531 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppt1O88531 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppt1O88531 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppt1O88531 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ppt1O88531 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms