Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad51dO55230 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad51dO55230 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad51dO55230 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms