Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja1O55176 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pja1O55176 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pja1O55176 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja1O55176 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pja1O55176 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms