Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Tpd52l1O54818 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tpd52l1O54818 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tpd52l1O54818 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms