Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bnc1O35914 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bnc1O35914 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bnc1O35914 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms