Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl25O35903 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl25O35903 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl25O35903 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl25O35903 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl25O35903 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl25O35903 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl25O35903 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl25O35903 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl25O35903 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl25O35903 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl25O35903 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl25O35903 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl25O35903 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl25O35903 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms