Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chil3O35744 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chil3O35744 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Chil3O35744 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chil3O35744 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chil3O35744 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chil3O35744 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chil3O35744 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chil3O35744 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chil3O35744 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chil3O35744 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chil3O35744 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chil3O35744 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chil3O35744 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Chil3O35744 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chil3O35744 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chil3O35744 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Chil3O35744 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Chil3O35744 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Chil3O35744 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms