Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Foxd2O35392 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Foxd2O35392 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Foxd2O35392 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms