Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KeraO35367 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KeraO35367 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KeraO35367 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KeraO35367 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KeraO35367 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KeraO35367 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KeraO35367 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KeraO35367 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KeraO35367 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KeraO35367 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KeraO35367 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KeraO35367 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KeraO35367 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KeraO35367 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KeraO35367 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KeraO35367 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KeraO35367 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KeraO35367 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KeraO35367 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KeraO35367 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KeraO35367 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KeraO35367 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KeraO35367 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KeraO35367 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KeraO35367 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KeraO35367 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KeraO35367 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KeraO35367 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KeraO35367 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KeraO35367 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KeraO35367 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KeraO35367 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KeraO35367 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KeraO35367 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KeraO35367 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KeraO35367 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KeraO35367 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KeraO35367 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KeraO35367 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KeraO35367 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KeraO35367 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KeraO35367 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KeraO35367 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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