Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ube3aO08759 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube3aO08759 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3aO08759 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms