Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mesp2O08574 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mesp2O08574 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mesp2O08574 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mesp2O08574 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mesp2O08574 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mesp2O08574 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 563.3 ms