Protein–RNA interactions for Protein: L7N476

Gm9611, Predicted gene 9611 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9611L7N476 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9611L7N476 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9611L7N476 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9611L7N476 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm9611L7N476 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm9611L7N476 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm9611L7N476 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9611L7N476 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9611L7N476 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9611L7N476 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm9611L7N476 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms