Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm7980L7N471 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Gm7980L7N471 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Gm7980L7N471 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm7980L7N471 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gm7980L7N471 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm7980L7N471 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Gm7980L7N471 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm7980L7N471 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Gm7980L7N471 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm7980L7N471 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm7980L7N471 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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