Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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