Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm5294J3QP53 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5294J3QP53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5294J3QP53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms