Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Zfp616J3QN14 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zfp616J3QN14 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp616J3QN14 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp616J3QN14 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms