Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pabpc4lG5E8X2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms