Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pnmal2G3X9N3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pnmal2G3X9N3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pnmal2G3X9N3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pnmal2G3X9N3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms