Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chrna9G3X8Z7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chrna9G3X8Z7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chrna9G3X8Z7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms