Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ubap1lG3UW59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubap1lG3UW59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ubap1lG3UW59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ubap1lG3UW59 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms