Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdh11xF6ZNL5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdh11xF6ZNL5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms