Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SmgcF6VRN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SmgcF6VRN1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SmgcF6VRN1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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