Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm8247F6VRJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm8247F6VRJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm8247F6VRJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms