Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933403O08RikF6UK53 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933403O08RikF6UK53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933403O08RikF6UK53 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms