Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
R3hdm1E9Q9Q2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
R3hdm1E9Q9Q2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms