Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc141E9Q8Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc141E9Q8Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccdc141E9Q8Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Ccdc141E9Q8Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ccdc141E9Q8Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms