Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Fndc1E9Q043 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Fndc1E9Q043 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Fndc1E9Q043 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms