Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb3D3Z6J4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms