Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm7257D3YX25 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm7257D3YX25 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm7257D3YX25 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms