Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tmf1B9EKI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tmf1B9EKI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tmf1B9EKI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms