Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp26c1B2RXA7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp26c1B2RXA7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp26c1B2RXA7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms