Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud7bB2RUR8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud7bB2RUR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud7bB2RUR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud7bB2RUR8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Otud7bB2RUR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Otud7bB2RUR8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Otud7bB2RUR8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Otud7bB2RUR8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms