Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc22a28B2RT89 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc22a28B2RT89 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Slc22a28B2RT89 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms