Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ythdc2B2RR83 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ythdc2B2RR83 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ythdc2B2RR83 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ythdc2B2RR83 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ythdc2B2RR83 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ythdc2B2RR83 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms