Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skint2A7XUX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skint2A7XUX6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.5 ms