Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M5A7VMS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-M5A7VMS3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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