Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm5640A3KG49 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5640A3KG49 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5640A3KG49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms