Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Upf2A2AT37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Upf2A2AT37 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Upf2A2AT37 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Upf2A2AT37 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms