Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lcn6A2AJB9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lcn6A2AJB9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lcn6A2AJB9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms