Protein–RNA interactions for Protein: A2A9R3

Mageb4, Melanoma-associated antigen B4, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mageb4A2A9R3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mageb4A2A9R3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mageb4A2A9R3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mageb4A2A9R3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Mageb4A2A9R3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Mageb4A2A9R3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mageb4A2A9R3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mageb4A2A9R3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mageb4A2A9R3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mageb4A2A9R3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mageb4A2A9R3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mageb4A2A9R3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms