Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdr2lA2A6T1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdr2lA2A6T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdr2lA2A6T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms