Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mbd3Q9Z2D8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mbd3Q9Z2D8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mbd3Q9Z2D8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mbd3Q9Z2D8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mbd3Q9Z2D8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms